Når Thunderball skulle filmes ble Kevin McClory tatt inn som enda en produsent, han hadde vunnet noen av rettighetene til filmen i en rettsak fordi han mente at boken Thunderball var basert på et manus som han, Ian Fleming, og Jack Whittingham hadde skrevet noen år tilbake.

Innspillingen av Thunderball startet 16. Februar 1965.
Effektene de hadde begynt med i Goldfinger fortsatte i Thunderball, f.eks. Aston Martin DB5 som hadde fått enda mer ekstrautstyr. Budsjettet denne gangen var på 5,6 millioner dollar.
Over 20 prosent av filmen er filmet under vann, verken før eller senere har dette vært gjort.

Fordi Kevin McClory kun hadde rettigheter til denne ene filmen, ble han ikke med på de neste, men etter suksessen av Thunderball fant McClory ut at han skulle lage sin egen version, Never Say Never Again.